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由于PCR技术可以快速特异地扩增任何期望的DNA片段和目的基因,因而在微生物的分子检测和鉴定领域具有广阔的应用前景,在食品级益生菌检测方面的研究也正逐步展开。
近年来,双歧杆菌分子生物学研究进展迅速,尤其在双歧杆菌遗传转化、基因克隆和表达系统等方面,已有很多研究报道。随着AFLP、RFLP、RAPD-PCR等DNA分子标记技术的发展,这些新技术在双歧杆菌遗传多样性分析、遗传图谱构建、种系发生研究中应用日益广泛。
已有的研究比较了双歧杆菌现有32个种及相关种的16s rRNA基因序列后,发现其1412~1432位的寡核苷酸减基序列(21个)在所有的双歧杆菌中相同,能作为双歧杆菌属特异的寡核苷酸片段,可用其作为PCR的引物来扩增双歧杆菌16S rRNA的基因片段。而模板DNA通过简单的SDS裂解菌体细胞,而后用蛋白酶K去除蛋白即可获得。在此条件下,所有的双歧杆菌可由PCR扩增产生典型的1.35kb的核苷酸片段,而其他细胞不产生此带,故用PCR技术能够进行双歧杆菌的检测、鉴定及分类。
而RAPD-PCR扩增图谱作为一种新的分子标记,具有个体特异性,国内已有研究用筛选的S256引物对9株7种双歧杆菌进行扩增得到了多态性图谱,从图谱中找到了属内种间共有条带,以及种内株间共有条带,同时也有在种水平和株水平上的特征性条带,它们有望作为菌种和菌株鉴定的依据,RAPD图谱具有作为工业益生菌菌株分子标记的潜力。
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