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利用适配体对金黄色葡萄球菌进行分离和富集是一种新型方法，携带金黄色葡萄球菌的样品在检测之前需要进行分离和富集等前处理过程。适配体作为生物识别物，可以与纳米磁珠结合从而用于目标菌体的分离与富集。Zhang等通过适配体功能化的磁珠实现了金黄色葡萄球菌的磁性分离，并通过培养基中电导率的变化测定了活菌数。Xu等将经过修饰的适配体探针固定在磁性水凝胶条形码上特异性吸附金黄色葡萄球菌，这个磁性水凝胶条形码可以减少其他靶标物的非特异性吸附，捕获效率高，捕获速度快且具有多重捕获能力。相比而言，大量磁性分离的研究都是用免疫磁珠进行的，主要原因是免疫磁珠的生物识别物为抗体，可以适应较为复杂多样的环境，故可应用于多种食品样品（或食品样品处理物）。而以适配体为生物识别物的磁性捕获往往是在水等简单样品中进行，从复杂的食品样品或食品样品处理物中磁性分离目标致病菌可能需要更多的研究。一般适配体往往是在特定的环境中筛选得到，比如特定的pH、特定的Mg2+浓度等，当这些环境改变，往往无法得到较好的亲和性。
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