MYB转录因子对不同植物结构基因和类黄酮合成影响不同，MYB蛋白在调控类黄酮生物合成途径中起着关键作用。ZHAI等在梨果实中克隆了3个候选MYB转录因子，分别为PbMYB10b、PbMYB9和PbMYB3，并通过过表达和RNAi瞬时检测进行功能验证，结果表明PbMYB10b作为花青素通路和原花青素通路的激活剂，但其功能可被其他MYB转录因子补充，阐明了在梨果实中类黄酮合成与MYB转录因子表达模式的关系。PbMYB9是原花青素、花青素和黄酮醇途径的激活剂，其作用是梨果实类黄酮生物合成所必需的。PbMYB3是PbMYB10的潜在调节因子。同时，PbMYB3的同源基因MdMYB3过表达可以激活果实中CHS、CHI、UFGT、FLS几个类黄酮途径基因的表达，因此认为这几种MYB转录因子可能是梨果中类黄酮生物合成的调控因子。ANWAR等从中国水仙中鉴定了一个R2R3MYB转录因子NtMYB2，并对其进行了功能表征。通过瞬时表达分析发现NtMYB2转录因子参与了花青素生物合成途径的调控，并可能通过下调中国水仙关键酶基因的转录来抑制花青素生物合成。ZHU等从菊花中分离出编码R2R3-MYB转录因子的CmMYB8基因并对其进行了功能表征，发现CmMYB8是菊花R2R3-MYB转录因子，对木质素和类黄酮化合物的合成起到负调控作用。LI等对鸢尾科单子叶开花植物小苍兰的R2R3-MYB的基因FhMYB5的功能进行了鉴定，相关分析表明，FhMYB5基因的表达与小苍兰体内花青素和原花青素的积累具有很好的一致性，FhMYB5单独作用时，轻微上调晚期类黄酮合成基因DFR和无色花色素双加氧酶基因（LDOX），而当FhMYB5与bHLH转录因子基因FhTT8L和FhGL3L共同发挥作用时，早期和晚期类黄酮合成基因均被明显激活，FhMYB5在烟草和拟南芥中的过表达也可明显上调参与总黄酮途径的基因表达，表明FhMYB5在小苍兰总类黄酮途径中发挥调控作用。TIAN等对协同调控原花青素和花青素生物合成的海棠的两种R2R3-MYB转录因子McMYB12a和McMYB12b进行了功能表征，结果发现McMYB12a主要通过与花青素生物合成基因启动子的结合来上调花青素生物合成基因的表达，而对原花青素生物合成基因的调控作用仅为次要，而McMYB12b则优先结合原花青素生物合成基因的启动子。烟草中过表达McMYB12a和McMYB12b改变了类黄酮生物合成基因的表达，促进了烟草花瓣中原花青素和花青素的积累，而利用保守的基因区域瞬时沉默会导致原花青素和花青素产量减少。同时，这两个基因在海棠果实中过表达和烟草中过表达具有相似的作用，在海棠中沉默McMYB12转录因子与在烟草中沉默该转录因子也具有相似的作用，揭示了海棠叶片依赖于McMYB12a和McMYB12b表达的自调节平衡来调控花青素积累。

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