红发夫酵母是天然虾青素的主要酵母来源，已经应用于水产饲料行业。对红发夫酵母合成虾青素的研究主要集中在菌株分离、诱变以及基因工程获得虾青素高产菌株方向。红发夫酵母是一种担子菌真菌，属于兼性嗜冷的低温型酵母，其合成的虾青素为右旋结构，是红发夫酵母次级代谢合成的主要类胡萝卜素。野生型红发夫酵母合成虾青素的浓度约为200～400μg/gDCW，菌株突变能够获得高产虾青素的突变体菌株。通过抗霉素、亚硝基胍、甲基硝基亚硝基胍等化学试剂、紫外及低能流子束技术对野生红发夫酵母菌株进行诱变，通过筛选获得虾青素高产菌株，PhaffiarhodozymaZJB00010经低能离子束注入诱导获得的E5042菌株中产量可达到2512μg/g。红发夫酵母能利用多种碳源、发酵周期短、能够在发酵罐中实现高密度培养、生产速度快的优势，使其已成为工业化生产虾青素的优良菌种。

此外，酵母工程菌株在虾青素生产方面有很好的应用前景。解酯耶氏酵母具有较高的IPP和DMAPP产量，研究发现CrtZ是催化β-胡萝卜素转化为虾青素的关键酶，在解酯耶氏酵母基因组中引入来源于念珠藻的β-胡萝卜素羟化酶CrtZ编码基因和来源于Paracoccussp.N81106的β-胡萝卜素酮醇酶CrtW的编码基因，得到的工程菌株ST7403中虾青素产量高达3.5mg/gDCW。在酿酒酵母中通过基因工程导入雨生红球藻的crtZ和bkt基因能够提升β-胡萝卜素向虾青素的转化效率，实现细胞内虾青素的积累。在GGPP合酶的阳性突变体中过表达tHMG1，CrtICrtY和CrtB三种限速酶的编码基因，优化后的二倍体菌株中过表达CrtZ、BKT的编码基因，虾青素累积量可达到了8.10mg/gDCW，值得注意的是合成的虾青素为左旋结构。

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