在农田土壤当中，重金属和农药的复合污染也普遍存在。有研究显示，亚洲和欧洲大多数农田土壤每年至少使用1次除草剂，给耕地带来了潜在的农药污染威胁。生态环境部和自然资源部2014年全国土壤污染状况调查公报显示，中国耕地土壤点位超标率为19.4%，主要污染物为重金属Cd、Ni、Cu、As、Hg、Pb以及农药DDT和多环芳烃类。Xu等在研究中国长江三角洲快速工业化地区—浙江省嘉兴市农田土壤重金属污染时发现，该地区存在Cu、Zn、Pb、Cr、Ni及Cd等污染风险，其中Hg污染风险来源于工业排放和含Hg农药的历史使用。樊倍希等在研究火力发电厂对周边农田土壤重金属污染的影响时发现，中国山西省中部地区Cd、Cr、Cu、Hg、Mn、Ni、Pb和Zn的含量均超过该省土壤环境背景值，且电厂周边农田土壤中各种金属均有一定程度的累积。曹建荣等在研究鲁西(中国山东省西部)粮食主产区耕地土壤重金属与农药污染状况时发现，污染程度较重的重金属为Cu、Ni和Zn，农药为六六六。Aleksandra等研究发现，在波兰各采样点耕地土壤中均检测到了DDT，其主要来源于历史残留。此外，在墨西哥和美国重要农业区华雷斯山谷土壤中，有机氯类农药和重金属也均有检出。

农田土壤中的重金属和农药污染还会造成二者在农产品中的残留问题。范静波在调查中国山西省长治地区番茄中农药残留和重金属污染时发现，番茄样品中农药检出率为28.0%，超标率为3.7%；重金属检出率为94.0%，其中，Pb为12.0%，Cd为94.0%。Markovic等在对塞尔维亚Obrenovac地区蔬菜产品进行检测时发现，其重金属Pb和Cd含量高于塞尔维亚国家法典所规定的最高水平，同时其毒死蜱和氯氰菊酯等农药残留也存在污染风险。

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