道地药材产地变迁的原因多种多样，有人为的因素，也有自然环境变化的因素，但大多数情况是二者共同作用的结果。随着地质地貌的变化，气候的改变，药材使用习惯的改变，人类生产方式的改变，以及人类活动范围的扩大，很多道地药材的产区也在随之变迁。

首先一个变化的原因是资源的破坏和枯竭。如人参，宋代以前以山西上党所产的为道地药材，但是随着过度的采挖和自然植被的破坏，山西等地区已经没有人参的资源了，于是辽东的人参便取代上党人参成为道地药材。类似的情况还有霍山的铁皮石制已被云南、浙江、广西等所产石制取代，内蒙的肉京蓉被新疆的管花肉京蓉取代等，都是因为原产地资源的耗尽，被迫寻找新的药用资源所导致的道地药材的产地迁移。

同时，随着人类活动范围的增大，以前的荒芜之地被人类更多的涉足后，新资源的发现也使药材的道地产地发生迁移。如川贝母，古时以为道地出于川西，现在，在相邻的西藏、青海等地，也大量出产优质川贝母。人参，在过去极度荒凉的远东地区也发现有人参的资源，俄罗斯还特别成立了叶利钦人参自然保护区来保护野生人参。

生产、栽培习惯的改变也是道地药材产地变化的重要原因。如，河南四大怀药之一的怀菊花，产地加工一般要等花大部分开放后，收割地上部分，分成小把，倒挂在木架上阴干，然后剪下花朵。

这种加工方法造成了怀菊花容易散瓣，产量低，当地药农不愿意种植，面积逐渐减小。怀药中的怀地黄也因其加工繁琐，年轻一代的药农不愿生产，而造成种植面积锐减。如果不改进道地药材的加工方法，有些传统道地药材有可能步怀菊花之后尘。而道地药材三七、川芎，不仅是因为原产地的种植减少，而且在新的道地产区所产质量甚佳，所以形成了新的道地产区。

另外，随着经济的发展，有些道地药材因为利润低，生产过程繁琐，药农已经不愿意栽种。如，江津是积壳和中只实的传统道地产区之一，帜壳和积实的原植物酸橙，因为产量低，药材加工较鲜品复杂，价格低廉，而在当地推广应用的脐橙，鲜果产量大，价格是药材的数倍。因此，药农已不愿意种植酸橙，江津产积壳、中只实明显减少。温江是郁金的传统道地产区，但是随着温江城市化建设速度的加快，温江郁金在市场上很难找到。

古今用药不一致，也是药材道地产区改变的原因之一。如古时所用的关白附子道地产区在东北，而现在所用的白附子以河南所产的禹白附为道地，因为古代所用的白附子为毛高科植物黄花乌头，与现在所用的天南星科之独脚莲完全不同。

由于地区之间的交流增多，很多我国本来不产的药材也开始栽培并形成道地药材，同时一些我国原本不用的药材，也开始栽培、使用。如木香过去从印度进口，是舶来品，故称“广木香”而现在由于在云南的大量引种成功后，形成了云南的道地药材“云木香”西红花过去靠从国外进口，由于现代栽培技术的进步，在我国的上海已经大量的室内种植，形成上海的优质药材。

另外，红景天等药材，本来是少数民族的习用药材，传统中医并不使用，但是由于现代的研究开发，使红景天成为西藏等地的道地药材。还有一些国外的药用植物，被引进国内并逐步形成规模，如广西引种的玫瑰茄、东北引种的紫锥菊等，也成为优质药材。